MIG-seq（multiplexed ISSR genotyping by sequencing）法は、近年開発されたばかりの次世代シーケンサーを用いたゲノムワイドな塩基配列多型検出法である（Suyama and Matsuki, 2015; Scientific Reports)。ユニバーサルなプライマーセットを用い、マルチプレックスPCRによって増幅された多数のマイクロサテライト間領域のPCR産物をシーケンシング・ライブラリとするため、生物種にかかわらず統一した手法で簡便に分析できることが大きな特徴である。また、PCR増幅が可能でさえあれば微量・劣化DNA試料でもゲノムワイドな解析に用いることが出来るため、この手法の適用範囲が広いのも魅力である。さらに、各サンプルにインデックス配列を付加することによって数百サンプルを一度に解析でき、作業にかかる日数はおよそ3日間、低価格（1,500円/サンプル程度)で、通常1000座程度のSNP情報を得ることができる。このような特徴を生かし、これまでに菌類・原生生物・植物・動物のさまざまな生物種を対象として、集団遺伝学・保全生態学・分類学といった幅広い分野への応用が進んでいる。
本集会では、はじめにMIG-seq法の原理と分析手順の概要について簡単に解説し（陶山）、その後に、MIG-seq法を用いた実際の研究例を紹介する（属内多種の系統解析：藤田、遺伝的多様性と適応度：成田、種識別マーカーの開発：長井）。最後にMIG-seqの特徴を生かしたその他のさまざまな目的での解析を紹介し、今後のさらなる応用可能性を中心に意見交換を行う。
コメンテーター　井鷺裕司（京都大・農）