| 要旨トップ | ESJ63 自由集会 一覧 | 日本生態学会第63回全国大会 (2016年3月、仙台) 講演要旨
ESJ63 Abstract


自由集会 W31 -- 3月24日 17:00-19:00 RoomD

メタバーコーディング・環境DNAバーコーディング解析の技法

企画者: 田辺晶史(水研セ・中央水研)

環境DNAやメタゲノムを用いたDNAバーコーディング法は、様々な環境での生物群集の情報をより省エネルギー・省コストで得られる技術として期待されており、特に微生物生態学の分野では多くの応用例が蓄積されている。大型生物を対象とする研究では、水生生物が水中に放出しているDNA=環境DNAを検出可能であることが実証され、今後応用が進むものと思われる。陸上生物であっても、すり潰してDNAを抽出するか、液体に溶いてからDNAを抽出することで同様の処理が可能である。この技術を応用することで、より多くの地点の群集を観測したり、より短い間隔で観測を行ったり、より網羅的な観測を行うことが可能になるが、サンプルの採集・DNA抽出・シーケンスは言うに及ばず、シーケンスデータから群集行列データへの変換、群集行列データの統計的分析にはこれまでとは異なる様々な落とし穴が存在し、新規参入のハードルとなっている。本集会では、それぞれの分析過程のテクニカルな解説を経験者や開発者が行い、落とし穴の回避方法や今後の課題と展望について議論する。

[W31-1] MiSeqを用いた超多検体分析:サンプリングからシーケンスまで  東樹宏和(京大・人環)

[W31-2] NGSデータからの超大規模群集行列データの作成  田辺晶史(水研セ・中央水研)

[W31-3] メタゲノムデータを用いた群集統計解析法:レアファクションから仮説検定まで  門脇浩明(京大・人環)


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