次世代シーケンシング技術を用いたゲノムワイド塩基配列分析法として2015年に講演者らが発表したMIG-seq（multiplexed ISSR genotyping by sequencing）法は、手軽な一塩基多型（SNP）ジェノタイピング技術として、発表以来多くの研究で使われてきた。我々の研究グループでは、手法発表後も引き続きMIG-seq法の細部にわたる技術的な検討を続け、大なり小なりの改良を加えてきた。これまでに一部公表してきた大きな改良点としては、１）1st PCRのアニーリング温度（48度から38度に）、２）インデックス（デュアル化）、３）データ解析方法（SNP検出の各種条件変更等）が挙げられる。その後さらに、４）1st PCR産物の精製・平均化ステップの追加なども加え、本質的な手法のメリットを維持しつつ、更なる高精度化と取得データ量の増大（高効率化）に成功している。これらの変更は、あくまでもより高精度化・高効率化を目的とした改良であり、オリジナル手法を否定するものではないが、より高レベルのデータ取得のために是非とも参考にしていただきたい。
本講演では、まずごく簡単にMIG-seq法の概要と改良法の要点を説明し、次にそれらによって得られた個体・品種・集団・種の識別を中心とした研究例を紹介する。特に、生データのフィルタリングや、SNP検出の条件設定に関しては、材料や研究目的に合わせた設定によって大幅な高精度化・高効率化が実現されることがしばしばあるため、それらの具体的事例を紹介しながら説明する予定である。本講演では、出来るだけ自由に議論を交わしながら、より多くの方々にMIG-seq法を使っていただくための機会になるよう、有意義に時間を使いたいと考えている。