| 要旨トップ | 目次 | | 日本生態学会第69回全国大会 (2022年3月、福岡) 講演要旨 ESJ69 Abstract |
一般講演(ポスター発表) P2-221 (Poster presentation)
[作成の目的]
維管束植物和名チェックリスト(https://www.gbif.jp/v2/activities/wamei_checklist.html)は,「和名に基づく維管束植物のリストやデータベースの利用に際し、異名を含む和名全般から標準的な和名を検討するための」チェックリストである.学名と比較して和名は比較的安定しているとの利点がある.とはいえ,異名や表記上のゆらぎなどから,単純な和名の統合や比較は困難であり,チェックリストの利用には慣れと多少の技術が必要である.運用補助用の維管束植物和名変換シート(https://wetlands.info/tools/plantsdb/nameconv/)が提供されているが,これらのデータはエクセル形式で提供されており,Rで解析する際には,エクセルでの手作業が必要である.そこで,Rで利用するためのパッケージwameicheckrを作成した.
[特徴]
・和名チェックリストの主要データを保持
・簡単な操作で和名の確認が可能
・和名チェックリストに追随して,データを更新(予定)
・GitHubで公開
・類似和名の検索が可能(version 0.9.1 新機能)
[インストール]
# install.packages("devtools") # 未インストールのとき
devtools::install_github("matutosi/wameicheckr", build_vignettes = TRUE)
[使い方]
library(wameicheckr)
# いろいろ省略
x <- c("スズノエンドウ", "ヤイトバナ", "チガヤ", "ハエドクソウ", "カンラン")
# チェックリストで検索
wamei_check(x, hub_master, jn_master, ds=c(GL, SF, WF, YL))
# 類似和名を検索
mosiya(x[1])
# 詳細な使用方法:https://github.com/matutosi/wameicheckr/blob/main/howtouse.md
[注意点]
・和名チェックリスト自体がバージョンアップ作業中(2021年11月11日現在)
・分類的に和名の指す範囲が異なるなど,分類学的な検討を要する
・バグがあるかも知れない(連絡先:matutosi@gmail.com)