日本周辺海域は地球上で最も多くの海洋観測点が分布している海域の一つであり、その観測密度は米国・欧州沿岸や赤道海域と同等に高密度な観測領域を形成している。その中でも水産研究機関は沿岸域に多くの観測点を有し、その定点観測は100年以上の歴史がある。1960年以降は日本の沿岸海域をほぼ毎月カバーする観測体制が整備され、高度経済成長期に始まる海洋汚染等の環境把握が開始された。この観測網は現在まで維持されている。
しかしながら、短期的かつ実用的な成果を望む昨今の社会情勢・研究動向下では、水産研究機関による海洋モニタリングも努力量不足に陥り、継続観測が困難になりつつある。その一方で、1980年代から続く漁獲量の減少を食い止め、適切な資源管理によって持続的な水産業の体制を構築することが早急の課題として挙げられている。沿岸海洋環境との解析が必須となる沿岸魚類の資源管理を新たに開始するなど、気候変動に適応した水産業の推進が始まっている。その実現には精緻なモニタリング体制の再構築とその活用が必要となる。近年では、環境の急速な変化・異常現象を迅速に現場へ伝えるための漁海況予報、気候変動が漁獲動向に及ぼす影響を把握・周知する取り組みなどを増加させてきた。
現在は、水産庁が進めるスマート水産業の実現にあわせて、漁業者自らが操業中に漁場環境を同時観測するシステム構築が始まっている。操業中に観測した環境データを迅速に解析・配信するための仕組みを作り、同時に海洋環境・漁獲量（魚類現存量）・位置情報との統合データセットを蓄積するデータサーバの構築を進めている。今後は、環境DNAを用いた定性な多様性情報・半定量的な漁獲対象種の資源量指標情報をデータセットに組み合わせ、海洋生物・海洋環境の持続的利用に向けた管理に資する総合的な海洋環境情報の構築を目指している。