生物は、彼らを取り巻く環境に適応し、多様な形態、行動、生理的形質を獲得してきた。では、これら適応的形質はどのような進化プロセスを経て獲得されるのか？これまで、発生生物学の観点から、進化の至近的メカニズムについて新たな知見を提供してきたのが進化発生学（Evo-devo）である。さらに近年の進化発生学は、生態学との癒合を果たし、異なる環境に適応した近縁な生物群（姉妹群や近縁集団）を比較することで、新たな適応的形質がどのように生じるのかという問いに答えようとしている。このような領域はマイクロ進化発生学（Micro-evo-devo）とも呼ばれ、多くはモデル生物とその近縁種を対象に行われてきた。しかし、分子生物学的・遺伝学的手法の発展に伴い、その研究対象は非モデル生物にも広がりつつある。また、形態に加えて生理や行動に関わる制御機構が比較され、より多様な適応進化の分子機構について新たな知見が提供されつつある。本集会では、近縁系統・集団間でこれら適応的形質の発生機構や制御ネットワークを比較し、適応進化の分子メカニズムに迫ろうと試みる若手研究者からその研究例を紹介し、今後の展望について議論する。