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本大会では，生態学会50周年記念事業委員会の 50周年記念大会ワーキンググループを中心に， 以下の４つの全体シンポジウムを企画しました． 全体シンポジウムは，つくば国際会議場・大ホール（約1000人収容）で行います．
| 3月20日（木） 14:50〜17:50 | L1: 個体群生態学の新しい展望：ダイナミクスから進化まで |
| 3月21日（金） 9:00〜12:00 | L2: 分子生態学：分子生物学的アプローチが拓く新たな展開 |
| 3月22日（土） 14:50〜17:50 | L3: 生態系のなかの生物群集：生物多様性と生態系機能の視点から |
| 3月23日（日） 10:00〜13:00 | L4: 21世紀/協働の時代の生態学を語る：環境保全と自然再生 |