| 要旨トップ | ESJ71 自由集会 一覧 | 日本生態学会第71回全国大会 (2024年3月、横浜) 講演要旨
ESJ71 Abstract


自由集会 W16  3月20日 13:00-14:30 Room D

ゲノミクスで迫る島嶼での植物進化【O】
Genomic approaches to plant evolution in insular systems【O】

高橋大樹(東北大学), 阪口翔太(京都大学)
Daiki TAKAHASHI(Tohoku Univ.), Shota SAKAGUCHI(Kyoto Univ.)

ゲノムは生物の進化の基盤であり、全ゲノム配列は生物の進化や多様性を理解するための重要な情報源である。近年の次世代シーケンサーの発展により、ロングリードデータや大量のショートリードデータを安価に取得することも可能になってきており、全ゲノム配列の決定をはじめとするゲノミクス研究に対する敷居も下がってきている。一方で日本における植物を対象としたゲノミクス研究はモデル植物の近縁種や栽培植物などの一部の種が中心となっており、野外の非モデル植物を対象としたゲノミクス研究が十分に普及しているとは言い難いのが現状である。そこで本集会では、進化の実験場とも言われる島嶼の植物を対象にゲノミクス研究を展開している4人の研究者が話題提供を行う。それぞれが国内外の海洋島や大陸島を対象に植物の環境適応、被食防衛進化、性進化の解明へとゲノミクスにより迫っており、研究対象種の設定から解析手法の選択、さらに最新の研究成果を紹介する。本集会により非モデル植物を対象としたゲノミクス研究の更なる振興を目指したい。

[W16-1]
マカロネシアで適応放散したキク科ノゲシ属の系統ゲノミクス *高山浩司(京都大学), Seon-Hee KIM(Dept. Botany, Kyoto Univ.), 今井亮介(森林総研), Arnoldo SANTOS-GUERRA(Canarian agriculture inst.), Juli CAUJAPé-CASTELLS(Viera y Clavijo Canary BG), 増田幸子(理研), 柴田ありさ(理研), 白須賢(理研), Seung-Chul KIM(Sungkyunkwan Univ.)
Phylogenomics of the explosive species diversification of the woody Sonchus alliance (Asteraceae) in the Macaronesian Islands *Koji TAKAYAMA(Dept. Botany, Kyoto Univ.), Seon-Hee KIM(Dept. Botany, Kyoto Univ.), Ryosuke IMAI(FFPRI), Arnoldo SANTOS-GUERRA(Canarian agriculture inst.), Juli CAUJAPé-CASTELLS(Viera y Clavijo Canary BG), Sachiko MASUDA(CSRS, Riken), Arisa SHIBATA(CSRS, Riken), Ken SHIRASU(CSRS, Riken), Seung-Chul KIM(Sungkyunkwan Univ.)

[W16-2]
ゲノムワイドSNPを用いた小笠原諸島固有樹木種における種分化パターンの解明 *鈴木節子(森林総研), 常木静河(愛知教育大学), 成田智史(京都大学), 須貝杏子(島根大学), 玉木一郎(森林文化アカデミー), 永野惇(龍谷大学, 慶応大学), 伊原徳子(森林総研), 井鷺裕司(京都大学), 加藤英寿(東京都立大学), 村上哲明(東京都立大学)
Unraveling species divergence patterns in endemic tree taxa of the Bonin islands using genome-wide SNPs *Setsuko SUZUKI(FFPRI), Shizuka TSUNEKI(Aichi Univ. of Education), Satoshi NARITA(Kyoto Univ.), Kyoko SUGAI(Simane Univ.), Ichiro TAMAKI(Gifu Academy of Forest Science), Atsushi J. NAGANO(Ryukoku Univ., Keio Univ.), Tokuko UJINO-IHARA(FFPRI), Yuji ISAGI(Kyoto Univ.), Hidetoshi KATO(Tokyo Metropolitan Univ.), Noriaki MURAKAMI(Tokyo Metropolitan Univ.)

[W16-3]
小笠原諸島で雌雄異株化したムラサキシキブ属の性決定ゲノム進化 *増田和俊(京都大学), 瀬戸口浩彰(京都大学), 長澤耕樹(京都大学), 鈴木節子(森林総研), 久保田渉誠(株式会社ファスマック), 佐藤真(株式会社ファスマック), 永野惇(龍谷大学, 慶応大学), 阪口翔太(京都大学)
Genomics of sex determination in the genus Callicarpa: a study of plant species that acquired a dioecious breeding system on oceanic islands *Kazutoshi MASUDA(Kyoto Univ.), Hiroaki SETOGUCHI(Kyoto Univ.), Koki NAGASAWA(Kyoto Univ.), Suzuki SETSUKO(FFPRI), Shosei KUBOTA(Fasmac Co., Ltd.), Shin S. SATOH(Fasmac Co., Ltd.), Atsushi J. NAGANO(Ryukoku Univ., Keio Univ.), Shota SAKAGUCHI(Kyoto Univ.)

[W16-4]
全ゲノム解析による屋久島産矮小植物の進化過程の解明 *高橋大樹(東北大学), 陶山佳久(東北大学), 長澤耕樹(京都大学), 石川直子(東北大学), 瀬戸口浩彰(京都大学), 阪口翔太(京都大学)
Evolutionary history of dwarf plants in Yakushima Island revealed by genomic analysis *Daiki TAKAHASHI(Tohoku Univ.), Yoshihisa SUYAMA(Tohoku Univ.), Koki NAGASAWA(Kyoto Univ.), Naoko ISHIKAWA(Tohoku Univ.), Hiroaki SETOGUCHI(Kyoto Univ.), Shota SAKAGUCHI(Kyoto Univ.)


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